MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Leuconostoc carnosum JB16 plasmid pKLC1

Total Repeats: 184

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018674	TGT	2	6	6	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018674	ATA	2	6	12	17	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018674	CAAA	2	8	31	38	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_018674	ATGT	2	8	43	50	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018674	TGG	2	6	73	78	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018674	CTTTT	2	10	79	88	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
7	NC_018674	ATT	2	6	95	100	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018674	ATTTT	2	10	144	153	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018674	TA	3	6	198	203	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018674	TA	3	6	206	211	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018674	TA	3	6	232	237	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018674	CATA	2	8	283	290	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_018674	AT	3	6	314	319	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018674	TTG	2	6	363	368	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018674	A	6	6	409	414	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018674	A	6	6	1587	1592	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018674	ATT	2	6	1716	1721	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018674	A	6	6	1732	1737	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018674	GC	3	6	1840	1845	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
20	NC_018674	TC	3	6	2550	2555	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_018674	TA	3	6	2606	2611	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018674	TAA	2	6	2639	2644	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018674	CAT	2	6	2740	2745	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_018674	A	7	7	2778	2784	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018674	AATA	2	8	2808	2815	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018674	T	6	6	2828	2833	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018674	A	6	6	2873	2878	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018674	CA	3	6	2936	2941	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_018674	TCC	2	6	4281	4286	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30	NC_018674	TAA	2	6	6879	6884	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018674	CTT	2	6	6885	6890	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_018674	ATT	2	6	6991	6996	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018674	AGG	2	6	7073	7078	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018674	CAA	2	6	7082	7087	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_018674	A	6	6	7134	7139	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018674	TAAT	2	8	7196	7203	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018674	AG	3	6	7226	7231	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018674	TTA	2	6	7271	7276	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018674	A	6	6	7282	7287	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018674	ATA	2	6	7323	7328	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018674	ACA	2	6	7946	7951	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_018674	TTG	2	6	7952	7957	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018674	AGT	2	6	8073	8078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018674	ACTATT	2	12	8107	8118	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_018674	T	6	6	8136	8141	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018674	A	6	6	8203	8208	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018674	AATATA	2	12	8240	8251	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018674	AAATA	2	10	8291	8300	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018674	A	6	6	8308	8313	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018674	AT	3	6	8321	8326	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018674	ATT	2	6	8680	8685	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018674	TTTAA	2	10	8775	8784	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018674	TATT	2	8	8841	8848	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018674	ATT	2	6	8883	8888	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_018674	A	7	7	8932	8938	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018674	CAA	2	6	8948	8953	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_018674	GTT	2	6	8957	8962	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018674	TTTC	2	8	8986	8993	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
59	NC_018674	ATG	2	6	9049	9054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018674	TAA	2	6	9071	9076	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018674	TAT	2	6	9114	9119	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018674	CTA	2	6	9179	9184	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_018674	ATT	2	6	9312	9317	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018674	CTT	2	6	9330	9335	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_018674	AGC	2	6	9349	9354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_018674	TAA	2	6	9375	9380	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_018674	CTATA	2	10	9399	9408	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
68	NC_018674	CTT	2	6	9435	9440	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_018674	TAA	2	6	9458	9463	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018674	AATT	2	8	10111	10118	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_018674	TA	3	6	10126	10131	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_018674	TGTAAA	2	12	10153	10164	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018674	TCA	2	6	10192	10197	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_018674	ATT	2	6	10606	10611	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_018674	TA	3	6	10646	10651	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_018674	TAA	2	6	10666	10671	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_018674	CA	3	6	10724	10729	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NC_018674	TAT	2	6	10761	10766	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_018674	TGA	2	6	10815	10820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_018674	ATA	2	6	10889	10894	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018674	TTAAT	2	10	10910	10919	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_018674	A	6	6	11050	11055	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_018674	AGT	2	6	11220	11225	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_018674	CAG	2	6	11243	11248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_018674	A	8	8	11257	11264	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_018674	TTA	2	6	11288	11293	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_018674	TA	3	6	11317	11322	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_018674	A	6	6	11345	11350	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_018674	A	6	6	11375	11380	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018674	A	6	6	11480	11485	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_018674	AACT	2	8	11534	11541	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
92	NC_018674	AT	3	6	11589	11594	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_018674	GTT	2	6	11612	11617	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_018674	AACTTA	2	12	11635	11646	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_018674	TCA	2	6	11652	11657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_018674	A	7	7	11753	11759	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_018674	TGAT	2	8	11767	11774	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
98	NC_018674	TAA	2	6	11779	11784	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_018674	AAT	2	6	11820	11825	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_018674	GAT	2	6	11870	11875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_018674	AAT	2	6	11891	11896	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_018674	TGA	2	6	11941	11946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_018674	CTTAT	2	10	12008	12017	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
104	NC_018674	ATT	2	6	12036	12041	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_018674	CAA	2	6	12094	12099	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_018674	TGT	2	6	12125	12130	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_018674	A	6	6	12214	12219	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_018674	ATG	2	6	12279	12284	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_018674	CCA	2	6	12315	12320	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
110	NC_018674	A	6	6	12326	12331	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_018674	AAT	2	6	12351	12356	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_018674	CAA	2	6	12369	12374	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_018674	CTC	2	6	12378	12383	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
114	NC_018674	GAG	2	6	12474	12479	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
115	NC_018674	AT	3	6	12492	12497	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_018674	TGA	2	6	12506	12511	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_018674	GTT	2	6	12530	12535	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_018674	TAT	2	6	12544	12549	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_018674	ACA	2	6	12556	12561	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_018674	ATT	2	6	12577	12582	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_018674	CTA	2	6	12616	12621	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_018674	GCT	2	6	15369	15374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_018674	C	7	7	15376	15382	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
124	NC_018674	TAA	2	6	15387	15392	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_018674	TCC	2	6	15745	15750	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
126	NC_018674	AAGA	2	8	15774	15781	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
127	NC_018674	AT	3	6	15787	15792	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_018674	TA	3	6	15804	15809	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_018674	CTT	2	6	15814	15819	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_018674	TCA	2	6	15838	15843	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_018674	T	7	7	15873	15879	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_018674	AAC	2	6	15985	15990	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_018674	GAC	2	6	16030	16035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_018674	TTG	2	6	16061	16066	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_018674	TAA	2	6	18844	18849	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_018674	TA	3	6	18869	18874	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_018674	CTCA	2	8	18875	18882	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
138	NC_018674	TCAC	2	8	18940	18947	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
139	NC_018674	CAAA	2	8	18982	18989	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
140	NC_018674	GTT	2	6	19003	19008	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
141	NC_018674	AGC	2	6	19032	19037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_018674	T	6	6	19780	19785	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_018674	TTCG	2	8	19894	19901	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
144	NC_018674	T	6	6	19979	19984	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_018674	CAA	2	6	20050	20055	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_018674	ATTGG	2	10	20070	20079	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
147	NC_018674	TAT	2	6	20195	20200	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_018674	CTAAA	2	10	20232	20241	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
149	NC_018674	AAAT	2	8	20256	20263	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_018674	AAT	2	6	20311	20316	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_018674	T	6	6	20662	20667	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_018674	TTA	2	6	20672	20677	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_018674	TCA	2	6	20686	20691	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
154	NC_018674	TTA	2	6	20701	20706	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_018674	ATA	2	6	20719	20724	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_018674	GAG	2	6	20759	20764	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
157	NC_018674	C	7	7	20795	20801	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
158	NC_018674	TAA	2	6	20856	20861	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
159	NC_018674	CAG	2	6	20914	20919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
160	NC_018674	A	7	7	20944	20950	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
161	NC_018674	TTA	2	6	20975	20980	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
162	NC_018674	AT	3	6	20987	20992	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
163	NC_018674	AT	3	6	21025	21030	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
164	NC_018674	CTT	2	6	21067	21072	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
165	NC_018674	AT	3	6	21082	21087	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
166	NC_018674	TGGC	2	8	21186	21193	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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168	NC_018674	CAACA	2	10	21358	21367	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
169	NC_018674	TTA	4	12	21385	21396	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
170	NC_018674	T	7	7	21404	21410	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
171	NC_018674	AAG	2	6	21446	21451	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
172	NC_018674	CAAG	2	8	21461	21468	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
173	NC_018674	TTGA	2	8	21479	21486	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
174	NC_018674	GAA	2	6	21508	21513	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
175	NC_018674	GAA	2	6	21533	21538	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
176	NC_018674	A	7	7	21537	21543	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
177	NC_018674	CAAA	2	8	21551	21558	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
178	NC_018674	GTC	2	6	21577	21582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
179	NC_018674	A	7	7	21653	21659	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
180	NC_018674	TATT	2	8	21685	21692	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
181	NC_018674	CTA	2	6	21778	21783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
182	NC_018674	TTGT	2	8	21799	21806	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
183	NC_018674	AGT	2	6	21830	21835	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
184	NC_018674	T	6	6	21860	21865	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.